Klubben blev stiftet som Osh, i 1965 skiftede man navn til FC Shakhtyor Osh, i 1967 til FC Alay Osh, i 1994 til FC Alay-Osh-Pirim, og i 1995 til FC Alay Osh.
Fra 1996 til 2002 var klubben fusioneret med Dinamo Osh som FC Dinamo-Alay Osh.
AFC Cup-placeringer: nr 4 i Gruppe 4 / D 2014 2017 2018 nr 4 i Gruppe 6 / F 2021
