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3. Liga 2008/09

Nr	Klub	K	S	U	T	Målscore			P
1	1.FC Union Berlin	38	22	12	4	59	-	23	78
2	Fortuna Düsseldorf	38	20	9	9	54	-	33	69
3	SC Paderborn 07	38	20	8	10	68	-	38	68
4	SpVgg Unterhaching	38	20	7	11	57	-	46	67
5	FC Bayern München II	38	14	17	7	54	-	38	59
6	BSV Kickers Emden	38	16	11	11	45	-	44	59
7	Offenbacher FC Kickers 1901	38	12	16	10	40	-	35	52
8	SV Sandhausen	38	12	14	12	58	-	52	50
9	SG Dynamo Dresden	38	13	11	14	46	-	46	50
10	FC Rot-Weiß Erfurt	38	13	11	14	46	-	48	50
11	VfB Stuttgart II	38	13	10	15	61	-	50	49
12	FC Erzgebirge Aue	38	12	12	14	43	-	43	48
13	Eintracht Braunschweig	38	12	9	17	46	-	51	45
14	Wuppertaler SV Borussia	38	11	12	15	36	-	45	45
15	SSV Jahn 2000 Regensburg	38	11	12	15	37	-	51	45
16	FC Carl Zeiss Jena	38	10	11	17	41	-	59	41
17	Werder Bremen II	38	10	10	18	49	-	58	40
18	SV Wacker Burghausen	38	10	10	18	40	-	65	40
19	VfR Aalen	38	8	15	15	38	-	60	39
20	SV Stuttgarter Kickers 1899	38	7	11	20	38	-	71	32
			266	228	266	956	-	956	1026

38 runder. Tre point for en sejr.

Playoff om oprykning:
SC Paderborn 07 vs VfL Osnabrück 1-0 og 1-0

Danske spillere: Kasper Jensen (Paderborn), Andreas Granskov (Werder Bremen II), Kristoffer Andersen (Aalen).

Topscorer
Fink, Anton, SpVgg Unterhaching, 21 mål

Tyskland